Nieuw DNA Multiscan-protocol voor watermonsters
19 mei 2025 - Glastuinbouw
Eurofins Agro heeft DNA Multiscan recent geoptimaliseerd. De huidige DNA-analyses maken doorgaans geen onderscheid tussen DNA uit levende cellen, dat is ingebouwd in de celstructuur, en vrij, inactief DNA afkomstig uit dode cellen. Dit vrije DNA kan in een monster aanwezig zijn en een bijdrage leveren aan een positief testsignaal, maar heeft geen invloed op het gewas. Met het nieuwe protocol wordt dit vrije DNA uit het monster verwijderd, zodat het geen storend signaal meer geeft. Dit verhoogt de betrouwbaarheid van de test in watermonsters.
Vernieuwd protocol
Voor de DNA Multiscan wordt elk monster voorbehandeld, of het nu water, grond, substraat of plantenweefsel betreft. Het resultaat is een gezuiverd extract dat actief DNA bevat, afkomstig uit levende schimmels en bacteriën, maar waarin ook vrij, inactief DNA uit dood materiaal aanwezig kan zijn. In de huidige test kan dit vrije DNA een storend signaal geven, vooral in watermonsters. Voor bodems en substraten is dit minder relevant, omdat vrij DNA daarin snel wordt afgebroken.
Vrij DNA verwijderd
In het vernieuwde protocol is een extra stap toegevoegd om het vrije DNA te verwijderen. Hierdoor ontstaat uiteindelijk een zuiverder signaal en kan de ziekteverwekker beter worden gedetecteerd. In bepaalde gevallen kan er nog DNA aanwezig zijn dat is ingekapseld in celmateriaal. Dit DNA maakt geen deel meer uit van een levende cel, maar kan toch een signaal geven. Dergelijk ingekapseld DNA wordt aangetroffen in water dat is ontsmet met bijvoorbeeld UV of H₂O₂.
Hoewel dit DNA na verloop van tijd wordt afgebroken, kan het direct na ontsmetting nog een signaal geven in de DNA Multiscan. De afbraaksnelheid hangt af van verschillende factoren, zoals tijd, temperatuur en microbiologische activiteit in het monster. DNA Multiscan is daarom niet geschikt voor het beoordelen van de effectiviteit van een ontsmetter.
